El Comité de Seguridad Nacional ofrece a la estudiante universitaria Caitlin Fairchild una beca para asistir a una escuela militar secreta ubicada en una base del desierto de Estados Unidos. Mientras está allí, conoce a nuevos amigos Percival Chang (Grunge) y Roxanne Spaulding (Freefall). Sin que ellos lo sepan, los directores de la escuela, Ivana Baiul y Matthew Callahan, están llevando a cabo un proyecto conocido como Gen 13, en el que realizan experimentos genéticos con sus alumnos en un complot para convertirlos en seres con superpoderes («go Gen Active»). y lanzar una insurrección contra el gobierno. La única persona en su camino es el coronel John Lynch de Operaciones Internas, un miembro original del proyecto Gen 12 que está investigando el proyecto Gen 13 y está decidido a exponer las operaciones ilegales de los directores.

Gen 13 es un equipo de superhéroes, protagonista desde 1994 de su propia serie de comic books, escrita originalmente por Jim Lee y Brandon Choi e ilustrada por J. Scott Campbell. Fue publicada inicialmente por Image Comics en la línea Wildstorm, hasta que esta pasó a ser un sello de DC Comics.